一、荒漠植物资源保护利用与生态修复

（一） 荒漠植物多样性监测与保护

（二）荒漠植物资源挖掘利用

（三）荒漠生态系统保护与恢复

二、特色动物资源保护与繁育

（一）特色动物资源多样性与遗传进化

（二）特色动物适应性进化的生物学基础

（三）特色动物优良品质功能基因挖掘与繁育

三、极端微生物资源与挖掘利用

（一） 重要微生物资源的收集与评估

（二）微生物功能与成分的深度挖掘

（三） 微生物资源的产业化利用

四、南疆特色果树种质资源与遗传改良

（一）特色果树种质资源研究

（二）南疆特色果树适应荒漠生境的机制研究

（三）特色果树遗传改良研究